Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDHD3Q9BSH5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDHD3Q9BSH5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms