Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms