Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms