Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2Q96Q42 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms