Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMTK3Q96Q04 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms