Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms