Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms