Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms