Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP36Q96G28 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms