Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms