Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAF2Q96CS3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms