Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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