Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms