Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO1Q92973 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms