Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms