Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms