Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDB2Q92466 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDB2Q92466 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms