Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSRNP3Q8WYN3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms