Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms