Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP1Q86WV1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms