Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms