Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms