Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms