Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms