Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms