Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC8EQ6NSJ5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms