Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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