Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCTP1Q6DN14 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms