Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNS3Q68CZ2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms