Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms