Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms