Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms