Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms