Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms