Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN4Q5BKX8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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