Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms