Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms