Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALFQ53S48 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms