Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC58Q4VC31 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms