Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LONRF3Q496Y0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms