Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms