Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP13-3Q3SY46 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms