Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms