Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL40Q2TBA0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms