Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms