Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SGCAQ16586 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCAQ16586 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms