Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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