Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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EXT1Q16394 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EXT1Q16394 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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EXT1Q16394 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EXT1Q16394 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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