Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SSX1Q16384 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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