Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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